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Binding

基于片段的藥物發(fā)現(xiàn)的化學(xué)位移擾動(dòng)分析

Mnova Binding可以用于基于片段的藥物發(fā)現(xiàn)的化學(xué)位移擾動(dòng)分析，是一個(gè)強(qiáng)大的工具，可以自動(dòng)處理2D HSQC實(shí)驗(yàn)的蛋白質(zhì)配體滴定譜圖，跟蹤峰值移動(dòng)并計(jì)算多個(gè)峰值的Kd。

對多個(gè)峰的Kd進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析，還可以將測量的CSP提交給第三方軟件（AFFINImeter），以便使用不同的結(jié)合模型對結(jié)合等溫線進(jìn)行高級分析。

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對1D和2D NMR滴定進(jìn)行化學(xué)位移擾動(dòng) (CSP) 分析

Binding

亮點(diǎn)

Mnova使RM數(shù)據(jù)的分析變得簡單，為分析可能有些棘手的數(shù)據(jù)提供了一套先進(jìn)的軟件解決方案。

直觀的工作流程，可讓您以交互方式或全自動(dòng)方式分析滴定譜圖CSP

自動(dòng)對峰值移動(dòng)進(jìn)行跟蹤、測量化學(xué)位移擾動(dòng) (CSP)，將其與配體濃度相匹配以計(jì)算Kd

校正擁擠譜圖區(qū)域中的自動(dòng)峰值移動(dòng)跟蹤

提供用于處理和堆疊多個(gè)2D HSQC譜圖的工具，以不同的顏色顯示

輕松導(dǎo)出CSP值，以進(jìn)一步研究配體-蛋白質(zhì)結(jié)合模型

Mnova Binding包含用于NMR的AFFINImeter的免費(fèi)1年的使用權(quán)

用于核磁共振的AFFINImeter允許對來自2D NMR滴定的結(jié)合等溫線進(jìn)行高級分析，以測量結(jié)合常數(shù) (KA)。結(jié)合等溫線直接從軟件Mnova導(dǎo)入，AFFINImeter-NMR中提供了一系列高級工具，以充分利用NMR數(shù)據(jù)，包括：

結(jié)合等溫線的全局分析

使用復(fù)雜的Binding模型進(jìn)行分析

先進(jìn)的算法可以保證收斂，避免局部極小值，并評估參數(shù)的不確定性、擬合優(yōu)度和結(jié)果的可靠性

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特征

譜峰跟蹤：

自動(dòng)跟蹤和測量具有CSP的HSQC疊加譜圖。左圖顯示了兩個(gè)歸屬譜峰的移動(dòng)。右側(cè)顯示了其中一個(gè)跟蹤峰“13C-H”的詳細(xì)信息，包括配體/蛋白質(zhì)的濃度比、任意維度的CSP測量值、歸一化CSP以及Kd的擬合結(jié)果和誤差。。

測量&擬合：

化學(xué)位移擾動(dòng)的常規(guī)選項(xiàng)卡顯示了滴定波譜、蛋白質(zhì)濃度、配體濃度以及配體與蛋白質(zhì)濃度比的配色方案列表。

它還顯示了所有分析峰的CSP測量和Kd擬合列表，以及Kd的平均值和標(biāo)準(zhǔn)誤差。

自動(dòng)分析：

只需在“titration file”中按順序列出滴定系列即可。所用配體的名稱編碼在“l(fā)igands file”中。當(dāng)CSP自動(dòng)運(yùn)行分析時(shí)，它會(huì)為“titration file”中列出的每個(gè)滴定創(chuàng)建不同的Mnova文件，并且Mnova文件根據(jù)配體的名稱進(jìn)行命名。